CosMx™ 空間分子イメージャー

生物学的知見を得るうえで事前設定されたハイプレックスパネルが搭載されています。パネルは、細胞タイプ同定、細胞状態、細胞間相互作用などに利用できる遺伝子を網羅しています。

費用効果の高い構築済みの1000プレックスパネルを適宜カスタマイズして利用することで、あらゆる実験で最大限の結果が得られます。

組織検体における転写物の空間的局在を検出するために1000プレックスRNAパネルを用いて探索したFFPEメラノーマ組織

上に示したのは、FFPE非小細胞肺がん（NSCLC）組織の1000プレックスRNA解析で検出された細胞1個当たりの転写物の数（左）と、NSCLC組織中の転写物の全体的な分布（右）です。CosMx SMIは感度が高く、ダイナミックレンジが広いため、コピー数の少ない遺伝子の転写物でも1細胞レベルで検出できます。

形態マーカータンパク質および核染色

Probing RNA transcripts in intact tissue

Cell segmentation

マルチモーダルに細胞領域を分割することで、細胞の境界を正確に検出できます。CosMxの細胞セグメンテーションは、細胞膜と形態マーカータンパク質の画像、機械学習を利用した細胞セグメンテーションアルゴリズム、転写物を基準としたセグメンテーションの精度向上を利用することで、組織の形態を保持したまま正確なシングルセルセグメンテーションを行います

RNAだけでなく、100種類に上るタンパク質を組織検体で検出し、空間情報を画像化します。上の画像は、FFPE正常大腸組織において、標的とした7種類のタンパク質を画像化したものです。