GeoMx® デジタル空間プロファイラー
GeoMx DSP: あなたの空間生物学へのガイド
GeoMx Digital Spatial Profiler（DSP）は、1枚のスライドから空間トランスクリプトミクスと空間プロテオミクスの形態学的コンテキストを提供します。
基礎研究から橋渡し研究まで、GeoMx DSPは、絶えず変化する研究ニーズに対応するように設計された、最も柔軟で堅牢な空間生物学のソリューションです。
GeoMx DSPでできる
不均一性を解決します。
機能的なセグメンテーションを使用して、組織と細胞集団を空間的に解決します。
より多くの検出に妥協はありません。
最高のプレックスと最高の感度で、より多くのトランスクリプトームとプロテオームを検出します。
一貫した結果で信頼できる結果を。
マルチサンプル分析とコホート研究により、比類のない再現性とスケーラビリティが容易になりました。
様々なサンプルに 確信をもって対応。
標準的な組織学ワークフローを使用して、FFPE、FF組織、およびTMAから実証済みの堅牢な結果を取得します。
構造が機能を決定します。 型にはまらない考え方を。
重要な生物学の全体像を把握するために、機能的に異なる細胞と構造のプロファイルを作成します。
迅速な解析。 より早く論文を。
より高いスループットと統合されたデータ分析ソフトウェアにより、論文に直結するデータを早く得ることができます。
本製品でできること
GeoMx DSPのワークフローは、既存の組織学的解析とスムーズに統合可能で、再現性がある堅牢な空間的オミックスデータを迅速に得ることができます。
全組織切片、FFPE または新鮮凍結切片を形態学的な染色でイメージ化し、RNA のハイブリまたは抗体でのタンパク質アッセイを行います。そして形態学的な染色に基づいて、プロファイリングする組織コンパートメントまたは細胞タイプを正確に選択してターゲットのレポーター分子を回収し、nCounter 分析システムまたはイルミナ シーケンサーのいずれかを使用して発現レベルをカウントできます。
生物学主導のプロファイリング
様々なプロファイリングを柔軟に利用して、組織の不均一性をキャプチャします
幾何学的プロファイリング
セグメンテーション・プロファイリング
細胞タイプ特異的プロファイリング
輪郭プロファイリング
グリッドプロファイリング
組織のさまざまな領域での発現の不均一性は何か？
個別の生物学的コンパートメント（例えば、Tumor-TME）の発現プロファイルはどう違うのか？
私の組織の特定の細胞集団の発現プロファイルは何か？
浸潤境界領域の両側で免疫環境はどのように変化するのか？
特定の組織領域の詳細なマッピングで明らかになった新しいターゲットは何ですか？
GeoMx論文
崩壊性糸球体症のデジタル空間プロファイリング
Collapsing glomerulopathy is a histologically distinct variant of focal and segmental glomerulosclerosis that presents with heavy proteinuria and portends a poor prognosis. Collapsing glomerulopathy can be triggered by viral infections such as HIV or SARS-CoV-2.
遺伝子発現と空間プロテオミクスプロファイリングを利用した原発性および転移性HER2陽性乳がんの腫瘍免疫微小環境。
Background: The characterization of the immune component of the tumor microenvironment (TME) of human epidermal growth factor receptor 2 positive (HER2+) breast cancer has been limited. Molecular and spatial characterization of HER2+ TME of primary, recurrent, and metastatic breast tumors has the potential to identify immune mediated mechanisms and biomarker targets that could be used to guide selection of therapies.
高悪性度AT/RT成分を特徴とするINI1欠損症（CNS LGDIT-INI1）を伴う中枢神経系低悪性度びまん性浸潤性腫瘍の空間分子プロファイリング
Key points: – diffusely infiltrative low-grade tumour with SMARCB1/INI1-deficiency (CNS LGDIT-INI1) has been proposed as a new entity – we report the first case of a child with a CNS LGDIT-INI1 with a high-grade AT/RT component at the time of initial surgery – methylation profiles of both the low- and the high-grade component yielded high similarity with ATRT-MYC – spatial transcriptome analyses showed upregulation of glioneuronal markers in the low grade component underlining the concept of diffuse infiltrative behaviour of CNS LGDIT-INI1 – high-grade tumour areas displayed increased translational activity and proliferation as well as MYC pathway activation.
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