CosMx™ SMI
FFPE データセット

貴重なサンプルからの空間生物学をもっと見ましょう 

CosMx™ Spatial Molecular Imagerは、完全に統合された最初のマルチオミクスシングルセル空間解析ソリューションであり、研究者はこれまでにないプレックス、解像度、細胞数で形態学的に無傷の組織を解析することができます。 CosMx SMIは、新鮮な凍結組織サンプルとホルマリン固定パラフィン包埋 (FFPE)組織サンプルの両方で、100万を超える細胞にわたって 1,000を超えるRNAと64を超えるタンパク質検体を細胞内解像度でイメージングできます。

FFPEサンプル中のRNAおよびタンパク質の分析は、量が限られていること、サンプルの劣化、およびそれらを扱うために必要なワークフローのために困難であることが知られています。 CosMx SMIシステムは、シンプルなサンプル調製ワークフローと堅牢なin situハイブリダイゼーションケミストリーを活用し、あらゆるサンプルタイプに対応します。

CosMx SMIのパワーを際立たせるために、FFPEサンプルのオープンソースデータセットを生成しました。 CosMx SMIは、究極の感度、特異性、堅牢な細胞セグメンテーション、および広範で高プレックスなパネルを組み合わせて、研究者が細胞アトラス、細胞間相互作用、組織微小環境の表現型を探索できるようにします。

提供するデータセット

ヒト膵臓 (RNA)

CosMx Whole Transcriptome パネルを使用した究極Plexでの空間シングルセル解析データを提供します。WTでの ヒト膵臓データセットでは希少な細胞タイプを識別でき、空間的コンテキストでの細胞間の相互作用を理解することで、これまでアクセスできなかった細胞の状況を包括的に理解できるようになります。

ヒト前頭皮質 (RNA)

CosMx 6000パネルによるヒトの脳組織に関するオープンソース データセットを使用して、空間シングルセル解析への飛躍を遂げましょう。 ヒトの前頭皮質の約 100 mm² 領域からのこのデータセットには、合計 194,000 を超えるシングルセルと約 3 億 3,100 万の転写物が含まれています。

ヒト肝臓 (RNA)

正常および癌性肝組織の2つのFFPEサンプルから空間的に分解されたシングルセルデータを調べて、疾患状態、組織微小環境、タンパク質イメージングに基づく細胞セグメンテーション、1000 以上の遺伝子の細胞内発現マップ、および空間的に分解された細胞型に関する空間的洞察を明らかにします。

マウス脳(RNA)

マウス脳の FFPE 組織を 2 つの冠状切片にわたって調べます。1 つは半球全体をカバーし、もう 1 つは海馬層と皮質の両側に広がり、合計 90,000 個を超えるシングルセルと約 2 億 2,500 万の転写産物が含まれます。

また、CosMx™ SMI プロトタイプで作成された非小細胞肺がんデータセットのアーカイブもあり、レビューに利用できます。